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甲基化研究服務(wù)

人全基因組DNA甲基化芯片



陸譜基于Illumina公司的iScan系統(tǒng),提供全面的人源全基因組DNA甲基化芯片服務(wù)。從陸譜推出的早期Methylation27 BeadChip芯片,到中期廣受歡迎的450K芯片以及新推出的850K(EPIC)芯片,位點(diǎn)數(shù)量不斷提升,覆蓋的基因區(qū)域更加廣泛,屬于公司的核心品牌服務(wù)之一。

不同課題的需求,豐富了陸譜在科研方案設(shè)計(jì)的經(jīng)驗(yàn);

不同類型樣本的處理,豐富了陸譜在檢測技術(shù)的經(jīng)驗(yàn);

不同數(shù)據(jù)分析的要求,豐富了陸譜在表觀調(diào)控信息處理的經(jīng)驗(yàn);

在甲基化芯片靶向位點(diǎn)深度優(yōu)化方面更是獨(dú)具優(yōu)勢,匯集更多優(yōu)化因素,為二期多中心大樣本驗(yàn)證保駕護(hù)航!


技術(shù)原理

850K芯片沿承了Illumina應(yīng)用在450K芯片中經(jīng)典的BeadArray技術(shù),通過Infinium I及II探針設(shè)計(jì),在對目標(biāo)區(qū)域全面覆蓋的同時也保證數(shù)據(jù)穩(wěn)定可靠。Infinium I的設(shè)計(jì)是通過兩種不同的探針的信號值來區(qū)分甲基化的CpG位點(diǎn)(C)和非甲基化的CpG位點(diǎn)(T)的比例;而在Infinium II的設(shè)計(jì)中,每個檢測位點(diǎn)只設(shè)計(jì)一個探針,通過比較該探針摻入的兩種熒光的信號值來計(jì)算目的位點(diǎn)的甲基化比例。



技術(shù)優(yōu)勢

1.豐富的多組學(xué)設(shè)計(jì)經(jīng)驗(yàn)

經(jīng)典的“EWAS+RNA-array”之外,“EWAS+GWAS”及“EWAS+代謝組”的整合方案設(shè)計(jì),更是極大拓寬了DNA甲基化的研究路線。及豐富了遺傳功能調(diào)控機(jī)制的研究思路。

2.完美的方案技術(shù)搭檔

陸譜的EWAS+Massarray聯(lián)合技術(shù)檢測品牌服務(wù),成為EWAS整體解決方案的技術(shù)保障,更是目前EWAS領(lǐng)域的經(jīng)典技術(shù)路線,CNS系列文章是很好的見證。

3.深度的EWAS差異位點(diǎn)優(yōu)化服務(wù)

一直以來,EWAS芯片分析帶來的上千個位點(diǎn)及區(qū)域差異化,無法深度篩選很有價值的靶向位點(diǎn)及區(qū)域進(jìn)行二期大樣本多中心的驗(yàn)證檢測,陸譜匯集比較全面,較前沿的優(yōu)化因素進(jìn)行深度挖掘,有效解決該服務(wù)領(lǐng)域的痛點(diǎn),也成為了陸譜的服務(wù)特色之一。


服務(wù)流程

1.樣本準(zhǔn)備

DNA提取-血液、組織等;

DNA質(zhì)檢-OD、電泳;

2.EWAS芯片檢測

亞硫酸鹽bisulfite處理基因組,胞嘧啶C轉(zhuǎn)化成尿嘧啶U,甲基化的C不反應(yīng),保持不變,處理后的DNA與芯片雜交掃描,甲基化狀態(tài)可通過計(jì)算機(jī)熒光信號比例來確定。

3.報(bào)告整理

原始數(shù)據(jù)、質(zhì)控評估;

實(shí)驗(yàn)流程報(bào)告;

4.數(shù)據(jù)分析

差異甲基化分析;

基因功能及通路分析;

與轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合分析;

 

芯片產(chǎn)品列表

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